Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRISP3P54108 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP3P54108 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms