Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA8P53708 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA8P53708 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms