Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLCSP50747 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLCSP50747 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLCSP50747 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLCSP50747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLCSP50747 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLCSP50747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLCSP50747 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLCSP50747 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLCSP50747 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLCSP50747 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLCSP50747 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLCSP50747 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLCSP50747 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLCSP50747 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLCSP50747 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLCSP50747 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLCSP50747 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLCSP50747 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms