Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX5P50542 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX5P50542 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX5P50542 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX5P50542 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX5P50542 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX5P50542 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX5P50542 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX5P50542 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX5P50542 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX5P50542 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX5P50542 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms