Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NUP153P49790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NUP153P49790 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NUP153P49790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
NUP153P49790 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.46
NUP153P49790 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NUP153P49790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NUP153P49790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NUP153P49790 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NUP153P49790 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NUP153P49790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NUP153P49790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NUP153P49790 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NUP153P49790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NUP153P49790 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NUP153P49790 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NUP153P49790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NUP153P49790 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NUP153P49790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUP153P49790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUP153P49790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUP153P49790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUP153P49790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUP153P49790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NUP153P49790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NUP153P49790 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NUP153P49790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
NUP153P49790 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP153P49790 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP153P49790 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP153P49790 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP153P49790 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP153P49790 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP153P49790 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NUP153P49790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NUP153P49790 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NUP153P49790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NUP153P49790 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP153P49790 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP153P49790 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP153P49790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NUP153P49790 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NUP153P49790 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NUP153P49790 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NUP153P49790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NUP153P49790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NUP153P49790 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NUP153P49790 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NUP153P49790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NUP153P49790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NUP153P49790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NUP153P49790 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP153P49790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP153P49790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP153P49790 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP153P49790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP153P49790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP153P49790 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NUP153P49790 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NUP153P49790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
NUP153P49790 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NUP153P49790 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NUP153P49790 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NUP153P49790 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NUP153P49790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NUP153P49790 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NUP153P49790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NUP153P49790 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NUP153P49790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NUP153P49790 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUP153P49790 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP153P49790 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP153P49790 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP153P49790 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP153P49790 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms