Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPFP49454 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPFP49454 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPFP49454 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPFP49454 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPFP49454 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPFP49454 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPFP49454 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPFP49454 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPFP49454 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPFP49454 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPFP49454 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPFP49454 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPFP49454 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPFP49454 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPFP49454 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPFP49454 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPFP49454 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPFP49454 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPFP49454 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPFP49454 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPFP49454 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPFP49454 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPFP49454 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPFP49454 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPFP49454 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPFP49454 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPFP49454 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPFP49454 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPFP49454 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPFP49454 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPFP49454 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms