Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms