Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A9P48067 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms