Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL21P46778 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL21P46778 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL21P46778 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL21P46778 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL21P46778 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL21P46778 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL21P46778 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL21P46778 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL21P46778 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL21P46778 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL21P46778 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL21P46778 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL21P46778 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL21P46778 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL21P46778 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL21P46778 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL21P46778 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL21P46778 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms