Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA4P43681 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA4P43681 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA4P43681 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms