Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA1P43355 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA1P43355 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA1P43355 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms