Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms