Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC1P41238 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC1P41238 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms