Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL4P36578 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL4P36578 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL4P36578 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPL4P36578 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL4P36578 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL4P36578 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL4P36578 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL4P36578 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL4P36578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL4P36578 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL4P36578 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms