Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNB1P35222 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms