Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDC2P34741 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDC2P34741 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDC2P34741 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDC2P34741 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDC2P34741 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDC2P34741 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDC2P34741 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDC2P34741 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDC2P34741 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDC2P34741 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms