Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDELR2P33947 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR2P33947 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms