Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP2P32456 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP2P32456 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP2P32456 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP2P32456 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP2P32456 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP2P32456 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP2P32456 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP2P32456 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP2P32456 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP2P32456 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP2P32456 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP2P32456 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP2P32456 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP2P32456 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP2P32456 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP2P32456 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms