Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD1P29536 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD1P29536 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD1P29536 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms