Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRABP2P29373 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms