Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms