Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5F1P24539 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5F1P24539 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms