Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK11BP21127 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK11BP21127 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms