Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNB1P20700 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNB1P20700 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMNB1P20700 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms