Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF1BP20333 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF1BP20333 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF1BP20333 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms