Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGCP20142 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGCP20142 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGCP20142 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGCP20142 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGCP20142 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGCP20142 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGCP20142 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGCP20142 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGCP20142 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGCP20142 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGCP20142 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGCP20142 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGCP20142 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGCP20142 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGCP20142 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGCP20142 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGCP20142 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGCP20142 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGCP20142 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PGCP20142 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms