Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM21P19474 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM21P19474 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM21P19474 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms