Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRAP18433 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRAP18433 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
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