Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GM2AP17900 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GM2AP17900 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GM2AP17900 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GM2AP17900 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GM2AP17900 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GM2AP17900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GM2AP17900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GM2AP17900 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GM2AP17900 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GM2AP17900 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GM2AP17900 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GM2AP17900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GM2AP17900 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GM2AP17900 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GM2AP17900 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GM2AP17900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GM2AP17900 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GM2AP17900 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GM2AP17900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GM2AP17900 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GM2AP17900 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GM2AP17900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GM2AP17900 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GM2AP17900 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GM2AP17900 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GM2AP17900 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GM2AP17900 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms