Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2C1P13056 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2C1P13056 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2C1P13056 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2C1P13056 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2C1P13056 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2C1P13056 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2C1P13056 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms