Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT3P12035 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT3P12035 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT3P12035 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT3P12035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT3P12035 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT3P12035 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT3P12035 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT3P12035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT3P12035 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT3P12035 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT3P12035 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT3P12035 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT3P12035 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT3P12035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT3P12035 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT3P12035 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms