Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VDRP11473 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VDRP11473 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VDRP11473 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VDRP11473 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VDRP11473 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VDRP11473 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDRP11473 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDRP11473 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VDRP11473 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDRP11473 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDRP11473 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDRP11473 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDRP11473 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VDRP11473 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VDRP11473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VDRP11473 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VDRP11473 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VDRP11473 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDRP11473 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDRP11473 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDRP11473 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms