Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYGBP11216 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYGBP11216 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYGBP11216 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYGBP11216 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYGBP11216 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYGBP11216 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYGBP11216 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYGBP11216 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYGBP11216 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYGBP11216 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYGBP11216 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYGBP11216 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYGBP11216 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYGBP11216 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYGBP11216 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PYGBP11216 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYGBP11216 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYGBP11216 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms