Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC192P0DO97 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC192P0DO97 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms