Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSH2P0DML3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSH2P0DML3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSH2P0DML3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms