Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RD3LP0DJH9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms