Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRCP08575 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRCP08575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRCP08575 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms