Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GP1BAP07359 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms