Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAVP06756 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms