Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGRP06401 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGRP06401 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PGRP06401 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGRP06401 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGRP06401 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGRP06401 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGRP06401 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGRP06401 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGRP06401 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGRP06401 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGRP06401 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGRP06401 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGRP06401 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGRP06401 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGRP06401 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGRP06401 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGRP06401 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGRP06401 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGRP06401 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms