Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB1P05556 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB1P05556 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms