Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP1P03956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP1P03956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP1P03956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP1P03956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP1P03956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP1P03956 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP1P03956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP1P03956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP1P03956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP1P03956 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP1P03956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP1P03956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP1P03956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP1P03956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP1P03956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP1P03956 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP1P03956 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP1P03956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP1P03956 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP1P03956 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP1P03956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP1P03956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP1P03956 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP1P03956 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP1P03956 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP1P03956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP1P03956 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP1P03956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms