Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
HLA-DRAP01903 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-DRAP01903 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms