Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFP01133 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFP01133 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EGFP01133 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EGFP01133 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EGFP01133 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EGFP01133 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EGFP01133 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EGFP01133 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EGFP01133 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFP01133 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFP01133 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EGFP01133 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EGFP01133 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFP01133 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFP01133 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFP01133 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EGFP01133 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFP01133 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFP01133 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFP01133 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFP01133 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFP01133 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFP01133 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFP01133 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFP01133 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms