Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSTAP01040 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSTAP01040 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSTAP01040 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSTAP01040 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSTAP01040 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSTAP01040 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSTAP01040 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTAP01040 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTAP01040 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTAP01040 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTAP01040 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSTAP01040 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CSTAP01040 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSTAP01040 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTAP01040 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTAP01040 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTAP01040 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTAP01040 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTAP01040 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSTAP01040 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms