Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTCP00480 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTCP00480 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTCP00480 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTCP00480 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTCP00480 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTCP00480 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTCP00480 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTCP00480 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTCP00480 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTCP00480 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTCP00480 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTCP00480 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTCP00480 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTCP00480 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTCP00480 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTCP00480 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTCP00480 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTCP00480 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTCP00480 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms