Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPP00450 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPP00450 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPP00450 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPP00450 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPP00450 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPP00450 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPP00450 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPP00450 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPP00450 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPP00450 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPP00450 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPP00450 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPP00450 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPP00450 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPP00450 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPP00450 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPP00450 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms