Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPO95630 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms