Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL3O95573 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL3O95573 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL3O95573 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms