Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF1O95521 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF1O95521 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF1O95521 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms